法轮功是否邪教组织，根据不同的标准或会有不同的结论。可以肯定的是，大部分参与练功的成员只当它是强身健体、修心养性的一门气功或宗教。中央政府也强调要「团结、教育绝大多数被蒙骗的群众」，把他们和需要依法严惩的「极少数犯罪分子」区别开来。可是，一声取缔令下，纯粹练气修心的信众也无法再如常练功了，书刊也全部没收了，对人民的宗教信仰和思想言论自由，不能说没有影响。
这次北京高调地颁布取缔邪教的立法决定和司法解释，用意看来是要总结打击法轮功的经验，综合成放诸四海皆准的通则，以儆效尤。问题在於法院和检察院颁布的对《刑法》的解释，有关「邪教」的定义太过广泛，有关「非法组织和利用邪教」的阐说，则过於政治化，使整份解释文件的说服力大打折扣。
在「邪教」定义上，司法解释指为「冒用宗教、气功或者其他名义建立，神化首要分子，利用制造、散布迷信邪说等手段，蛊惑、蒙骗他人，发展、控制成员，危害社会的非法组织」。「神化首要分子」确是伤天害理的邪教的共有特徵，却非邪教所独有，不少合法社团和政党亦是如此，至於何谓「迷信邪说」、「蛊惑他人」、「危害社会」，则更是众说纷纭，一些不涉骗财骗色、不导人伤害自己或他人的组织，也可能被打为邪教。
在「邪教活动」方面，今日颁布的司法解释也有过於笼统的问题，最主要的一点是过分针对意见的表达，例如把「聚众围攻、冲击、扰乱国家机关」，「非法举行集会、游行、示威」，「煽动、组织成员围攻、冲击、强占、哄闹公共场所」，「抗拒有关部门取缔」等，统统列为应予起诉的罪行。其实内地已有严苛的限制示威、游行和集会的法规，再加上「围攻、冲击、强占、哄闹」等未必涉及暴力的抗议行为，难免令人认为文件针对的其实是民众不满或异见者的聚众抗议活动，这对於中国的国际形象实在毫无好处。（1999年11月1日）
