2000年10月1日，王书军因進京上访，被绑架回来后被非法判刑三年，关押在石家庄第四监狱。石家庄第四监狱是邪恶的黑窝，王书军在那里因不放弃修炼受尽了折磨，于2003年10月才被放回家。

2004年农历正月初六，又被成安县公安局闯入家中，强行绑架到县看守所。当时王书军从监狱回来不久，身体还很虚弱，被迫害得生命出现危险。家属找到公安局要人，县政保股恶徒连日红故意推脱责任不肯放人。后来在家人的坚决要求下才把人放出，但又敲诈2000元，关押2个多月才把人放回。

可回来不久，王书军于2004年4月再次被邯郸610曹志霞之流，指使县公安局连日红等恶徒，以王志军不转化为由，再次强行从家里绑架到邯郸市洗脑班。（邯郸劳教所专管队）洗脑班恶徒对他進行惨无人道的摧残，王书军绝食抗议20多天。长期的监狱折磨，使他年轻而健康的身体已极度虚弱，在洗脑班关押一个多月后，王书军已是奄奄一息，但他仍然坚持自己的信仰，坚决不写保证书。曹志霞之流看他身体实在不行了，怕担责任才放他回家。可长期的迫害使王书军的身体再难恢复，王书军于2004年6月20日凌晨4点含冤去世。